Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cul9Q80TT8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul9Q80TT8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms