Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pcdh8Q7TSK3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms