Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PhkbQ7TSH2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms