Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ckap2lQ7TS74 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2lQ7TS74 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms