Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prrc2bQ7TPM1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrc2bQ7TPM1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms