Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Trappc6aQ78XR0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc6aQ78XR0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Trappc6aQ78XR0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc6aQ78XR0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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