Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed3Q78IS1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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