Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd3eapQ76KJ5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd3eapQ76KJ5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms