Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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Cnih3Q6ZWS4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnih3Q6ZWS4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Cnih3Q6ZWS4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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Cnih3Q6ZWS4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Cnih3Q6ZWS4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Cnih3Q6ZWS4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnih3Q6ZWS4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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