Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LcorQ6ZPI3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorQ6ZPI3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorQ6ZPI3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorQ6ZPI3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorQ6ZPI3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorQ6ZPI3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorQ6ZPI3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorQ6ZPI3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LcorQ6ZPI3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorQ6ZPI3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorQ6ZPI3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorQ6ZPI3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorQ6ZPI3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorQ6ZPI3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorQ6ZPI3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorQ6ZPI3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorQ6ZPI3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LcorQ6ZPI3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms