Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms