Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GcsamQ6RFH4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms