Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Znf316Q6PGE4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf316Q6PGE4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms