Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFC5

Lrit2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit2Q6PFC5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrit2Q6PFC5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms