Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfrlQ6PE55 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms