Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms