Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhb9Q6PB60 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms