Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp2d40Q6P8N9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms