Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnpo3Q6P2B1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms