Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd2Q6NXI6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rprd2Q6NXI6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms