Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1Q6NXH3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms