Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr44Q6NVE8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms