Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc66Q6NS45 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc66Q6NS45 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms