Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep78Q6IRU7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms