Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CltbQ6IRU5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CltbQ6IRU5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CltbQ6IRU5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CltbQ6IRU5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CltbQ6IRU5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CltbQ6IRU5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CltbQ6IRU5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CltbQ6IRU5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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