Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Carmil1Q6EDY6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Carmil1Q6EDY6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms