Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q6DFW0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q6DFW0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q6DFW0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms