Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp7Q6A4J8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms