Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Jmjd1cQ69ZK6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Jmjd1cQ69ZK6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Jmjd1cQ69ZK6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Jmjd1cQ69ZK6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Jmjd1cQ69ZK6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Jmjd1cQ69ZK6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Jmjd1cQ69ZK6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Jmjd1cQ69ZK6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Jmjd1cQ69ZK6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Jmjd1cQ69ZK6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Jmjd1cQ69ZK6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms