Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp4Q68FH0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms