Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg9aQ68FE2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg9aQ68FE2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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