Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fnip1Q68FD7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fnip1Q68FD7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms