Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Arhgef39Q66JY6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms