Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ino80dQ66JY2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ino80dQ66JY2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms