Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnna3Q65CL1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms