Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Top2bQ64511 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms