Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ca4Q64444 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms