Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt12Q64291 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms