Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim24Q64127 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms