Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc18Q640L5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
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