Protein–RNA interactions for Protein: Q63959

Kcnc3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, mousemouse

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Length 769 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc3Q63959 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Kcnc3Q63959 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Kcnc3Q63959 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Kcnc3Q63959 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Kcnc3Q63959 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Kcnc3Q63959 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Kcnc3Q63959 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Kcnc3Q63959 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Kcnc3Q63959 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnc3Q63959 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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