Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Vat1Q62465 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms