Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20865Q62460 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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