Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CcncQ62447 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcncQ62447 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CcncQ62447 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms