Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sp4Q62445 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sp4Q62445 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms