Protein–RNA interactions for Protein: Q62283

Tspan7, Tetraspanin-7, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan7Q62283 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan7Q62283 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan7Q62283 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan7Q62283 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan7Q62283 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan7Q62283 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan7Q62283 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan7Q62283 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan7Q62283 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan7Q62283 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan7Q62283 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan7Q62283 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan7Q62283 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan7Q62283 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tspan7Q62283 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tspan7Q62283 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan7Q62283 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan7Q62283 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan7Q62283 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan7Q62283 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan7Q62283 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan7Q62283 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan7Q62283 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan7Q62283 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan7Q62283 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms