Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Six3Q62233 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Six3Q62233 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six3Q62233 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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