Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SnrpaQ62189 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms