Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssr4Q62186 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssr4Q62186 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms