Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema3cQ62181 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Sema3cQ62181 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema3cQ62181 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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